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    1. DNA序列分析服務 首頁 ? 服務項目 ? 科研服務 ? DNA序列分析服務

      Sanger法測序(一代測序)
      Sanger法測序通過利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物。直到摻入一種鏈終止核苷酸為止。每一次序列測定由一套四個單獨的反應構成,每個反應含有所有四種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一種不同的雙脫氧核苷三磷酸(ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基團,使延長的寡聚核苷酸選擇性地在G、A、T或C處終止。終止點由反應中相應的雙脫氧而定。每一種dNTPs和ddNTPs的相對濃度可以調整,使反應得到一組長幾百至幾千堿基的鏈終止產物。它們具有共同的起始點,但終止在不同的的核苷酸上,可通過高分辨率變性凝膠電泳分離大小不同的片段,凝膠處理后可用X-光膠片放射自顯影或非同位素標記進行檢測。

      基康公司擁有Applied Biosystems研制的領先國際水平的毛細管基因分析儀(3500&3730),是測序和片段分析的金標準。目前主要應用于:定向擴增子重測序;腫瘤個體化用藥;細菌、真菌和病毒鑒定及眾多不同的片段分析等領域。


      流程圖

       


       

      高通量測序

      高通量測序技術(又稱為下一代測序技術,Next Generation Sequencing)是對基因測序的一次革命性的改變,幾十萬到幾百萬條核酸分子可以一次性的進行序列測定。同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能, 所以又被稱為深度測序(Deep sequencing)。 基康公司不僅擁有可擴展、簡便性和高測序速度的臺式個人化操作基因組測序儀(Ion PGM,主要適用于擴增子測序、微生物測序、病毒測序、線粒體測序等應用領域),同時還擁有最新一代的,功能更強大的Ion Proton平臺,其擁有比Ion PGM?測序儀高1000倍的芯片,將使得全基因組測序變得觸手可及,完全可以滿足個人全基因測序的目的??梢蕴峁┰趲讉€小時內完成測序所需的速度的強大的半導體技術,以及擁有高達10Gb的通量和讀取高達200bp的堿基片段。主要適用于微生物測序、全基因組重測序,全外顯子組重測序和全轉錄組重測序以及Denovo測序,DNA甲基化,CHIP-seq等各領域。


      基康公司擁有的二代測序平臺應用領域比較:


      二代測序流程圖:


      微衛星DNA(short tandem repeats,STR)基因掃描檢測

      微衛星(microsatellite MS)是由長度為2-6個堿基對的短串聯重復序列(short tandem repeat STR),重復次數一般為10~60多次,基因片段長度在400個堿基以下。這些重復序列廣泛存在于人類基因組中。由于它具有高度多態性、高雜合度及遺傳穩定和突變率低的特點,作為第二代遺傳標記被廣泛應用。
      STR分析服務是將熒光標記的DNA片段,如PCR產物在ABI測序儀上對大小、數量進行分析檢測的過程,被廣泛運用于遺傳圖譜構建、群體遺傳研究、個體間親緣關系鑒定、基因定位等。上?;倒究梢蕴峁奈⑿l星序列篩選、引物設計合成、PCR擴增、毛細管電泳及數據處理分析的全套服務。


      基因掃描檢測結果示意圖:

       


      單核苷酸多態性(SNP)檢測
      SNP(Single Nucleotide Polymorphism),即單核苷酸多態性,是由于單個核苷酸改變而 導致的核酸序列多態。一般來說,一個SNP位點只有兩種等位基因,因此又叫雙等位基因。SNP在人基因組中的發生頻率比較高,大約平均每1000個堿基中就有一個多態位點 ,是繼微衛星之后的第三代遺傳標記。有些SNP位點還會影響基因的功能,從而導致生物性狀改變甚至致病?;赟NP的上述特點,它被廣泛用于群體遺傳學研究(如生物的起源、進化及遷移等 方面),和疾病相關基因的研究,在藥物基因組學、診斷學和生物醫學研究中起重要作用。

      基康公司可以提供多樣的檢測技術進行檢測:


      測序檢測

      測序是進行SNP檢測的金標準,不僅有適合于少量位點檢測的高性價比,高精確度的Sanger測序,對于位點數量大,樣本量多的檢測,上?;颠€擁有最新的高通量二代測序技術,不僅不增加大量檢測的成本,能夠更高精、高效的完成檢測。


      測序分型結果示意圖:


      TaqMan探針法SNP檢測
      上?;倒疽M并建立了整套的TaqMan-MGB-探針合成、熒光定量PCR的SNP檢測技術平臺,其中包括7900全自動高通量熒光PCR檢測儀及7500熒光PCR檢測儀,可以快捷、高效的提供高精確度、高通量、全自動化數據處理的SNP檢測服務。


      探針檢測原理示意圖:


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